Институт  является крупнейшим в России  координирующим центром  исследований в области питомниководства. Базируясь на фундаментальных исследованиях в области вирусологии, биотехнологии и инновационных достижениях ведущих учёных, под его эгидой была впервые создана Научно обоснованная система ведения питомниководства России (80-годы), принята научная терминология.

Учёными института детально разработаны такие технологии размножения растений, как зелёное черенкование (удостоена Государственной премии РФ) и получение саженцев методом зимней прививки, усовершенствованы способы размножения ягодных культур in vitro. Всего получено более 80 разработок.

Указом Президента РФ №2084 от 26.12. 2000 г. ученым института Поликарповой Ф.Я., Кашину В.И. и Трушечкину В.Г. была присуждена Государственная премия за работу «Научные основы вегетативного размножения растений методом зеленого черенкования». По инициативе ВСТИСП были внесены изменения в Федеральный закон «О семеноводстве», касающиеся основных понятий, установленных Национальными стандартами России и соответствующих международных норм.

Под эгидой института разработана вся нормативная документация, способствующая инновационному развитию питомниководства России: «Положение о базовом питомнике плодовых и ягодных культур» (2009 г.), «Технология получения сертифицированного посадочного материала плодовых и ягодных культур» (2009 г.), «Стратегия развития садоводства и питомниководства в Российской Федерации на период до 2020 г.» (2012 г.) и др.

Национальные стандарты России в области питомниководства (ГОСТ Р53135. Посадочный материал плодовых, ягодных, субтропических, цитрусовых культур и чая; ГОСТ Р53044. Материал плодовых и ягодных культур посадочный (термины и определения); ГОСТ Р54051. Плодовые и ягодные культуры. Стерильные культуры и адаптированные микрорастения. Технические условия), разработанные в 2008-2010 гг., будут действовать в Российской Федерации до 2018 г.

На базе института проведено 6 семинаров для специалистов Госсеминспекции, Российского сельскохозяйственного центра (ФГБУ «Россельхозцентр») по сертификации посадочного материала.

Запатентованные элементы технологий (авторские свидетельства и патенты РФ №№ 1159514, 1197597, 2204235, 2203528) и «Способ тиражирования садовых культур высших категорий качества методом настольной прививки» (патент РФ № 2498559 от 20.11.2013 г.) используются в настоящее время с целью получения саженцев для закладки первого в России питомника по производству базисных клонов в институте. С дальнейшим развитием базы для внедрения инноваций запатентованные разработки будут широко использоваться как в России, так и за её пределами.